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中国医科大学学报 ›› 2017, Vol. 46 ›› Issue (10): 895-898.doi: 10.12007/j.issn.0258‐4646.2017.10.008

• 论著 • 上一篇    下一篇

鼻息肉的全基因表达谱

白伟良,宋岩,王枭维,李婷,项清华,周倩,李进兴   

  1. 中国医科大学附属盛京医院耳鼻咽喉科,沈阳 110004
  • 收稿日期:2017-04-21 出版日期:2017-10-30 发布日期:2017-10-16
  • 通讯作者: 白伟良 E-mail:bweiliangcmu@163.com
  • 作者简介:白伟良(1972 -),男,教授,博士
  • 基金资助:
    辽宁省科学事业公益研究基金(2013001010);沈阳市科 学技术计划(F11-264-1-07,F13-220-9-21)

Gene Expression Profiling in Nasal Polyp

BAI Weiliang,SONG Yan,WANG Xiaowei,LI Ting,XIANG Qinghua,ZHOU Qian,LI Jinxing   

  1. Department of Otorhinolaryngology,Shengjing Hospital,China Medical University,Shenyang 110004,China
  • Received:2017-04-21 Online:2017-10-30 Published:2017-10-16

摘要: 目的 研究鼻息肉的全基因表达谱情况,探寻其与正常鼻腔黏膜的基因表达差异。方法 提取鼻息肉中的RNA,将RNA合成 双链的cDNA,将标 记的cDNA在Roche NimbleGen基因 芯片上 进行杂 交。应用Axon GenePix 4000B scanner进 行扫描,应用 NimbleScan软件进行图像分析,探针及基因水平标准化后进行计算。结果 与正常鼻腔黏膜相比,鼻息肉中有1 000个基因表达 上调,占2.22%(1 000/45 033),有1 123个基因表达下调,占2.49%(1 123/45 033)。经过信号通路分析,发现在核糖体、蛋白酶体、 柠檬酸循环、膀胱癌、非小细胞肺癌、神经胶质瘤、子宫内膜癌、内质网蛋白合成、慢性髓样白血病、谷胱甘肽代谢等信号通路中 相关基因表达上调,在嗅觉传导、自然杀伤细胞介导的细胞毒性、细胞色素P450的化合物代谢、细胞色素P450的药物代谢、抗原 加工和呈递、疟疾、移植物抗宿主疾病、视黄醇代谢、亚油酸代谢、戊糖和葡萄糖醛酸转换等信号通路中相关基因表达下调。结论 鼻息肉的发生、发展与多个基因及信号通路的表达升高或降低有关,鼻息肉全基因表达谱的研究为探求鼻息肉的发生机制 提供了有益的线索。

关键词: 鼻息肉, 基因芯片, 基因表达, 信号通路

Abstract: Objective To analyze the gene expression profiles of nasal polyp and gene expression differences between the nasal pol- yp and normal nasal mucosa. Methods Total RNA from nasal polyp tissues was purified and synthesized into double-stranded cDNA. The cDNA was labeled and hybridized in a NimbleGen hybridization chamber. The slides were scanned using the Axon GenePix 4000B microarray scanner. Scanned images were analyzed using NimbleScan software. The probes and gene levels were standardized and calcu- lated. Results Compared with normal nasal mucosa tissues,expression of 2.22%(1 000/45 033)of genes was up-regulated in all cases of nasal polyp tissues,while 2.49%(1 123/45 033)of genes were down-regulated in all cases of nasal polyp tissues. We found genes related to the ribosome,proteasome,citrate cycle(TCA cycle),bladder cancer,non-small cell lung cancer,glioma,endometrial cancer,protein processing in the endoplasmic reticulum,chronic myeloid leukemia,and glutathione metabolism were up-regulated.Genes related to olfac- tory transduction,natural killer cell-mediated cytotoxicity,metabolism of xenobiotics by cytochrome P450,drug metabolism-cytochrome P450,antigen processing and presentation,malaria,graft-versus-host disease,retinol metabolism,linoleic acid metabolism,and pentose and glucuronate interconversions were down-regulated. Conclusion Multiple genes or pathways may be involved in the occurrence and development of nasal polyp. Gene expression profiling provides insight into the mechanism of nasal polyp development.

Key words: nasal polyp, gene chip, gene expression, signaling pathway

中图分类号: 

  • R765.2
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