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中国医科大学学报 ›› 2019, Vol. 48 ›› Issue (3): 201-204.doi: 10.12007/j.issn.0258-4646.2019.03.002

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泛癌症分析DEAH盒解旋酶16的表达及其预后意义

胡明1, 张淑红2, 陈跟林3, 凌存宝3, 樊伟平3, 孙海燕4, 刘爽2, 张虎3   

  1. 1. 佳木斯大学附属第一医院普外三科, 黑龙江 佳木斯 154002;
    2. 佳木斯大学基础医学院生物学教研室, 黑龙江 佳木斯 154007;
    3. 江苏医药职业学院基础医学部生物化学教研室, 江苏 盐城 224005;
    4. 江苏医药职业学院护理学院内科护理学教研室, 江苏 盐城 224005
  • 收稿日期:2018-04-28 出版日期:2019-03-30 发布日期:2019-03-06
  • 通讯作者: 张虎 E-mail:Yuntian8239@126.com
  • 作者简介:胡明(1980-),男,主治医师,硕士.
  • 基金资助:
    国家自然科学基金(31471312);江苏医药职业学院科技创新团队建设计划(20188104);江苏省“青蓝工程”项目(2016)

Pan-Cancer Analysis of DEAH-Box Helicase 16 Expression and Prognostic Significance

HU Ming1, ZHANG Shuhong2, CHEN Genlin3, LING Cunbao3, FAN Weiping3, SUN Haiyan4, LIU Shuang2, ZHANG Hu3   

  1. 1. Department of General Surgery, The First Affiliated Hospital of Jiamusi University, Jiamusi 154002, China;
    2. Department of Biology, Basic Medical College, Jiamusi University, Jiamusi 154007, China;
    3. Department of Biochemistry, Basic Medical College, Jiangsu Vocational College of Medicine, Yancheng 224005, China;
    4. Department of Internal Medicine Nursing, College of Nursing, Jiangsu Vocational College of Medicine, Yancheng 224005, China
  • Received:2018-04-28 Online:2019-03-30 Published:2019-03-06

摘要: 目的 泛癌症分析DEAH盒解旋酶16(DHX16)的表达、预后意义及作用机制。方法 利用癌症基因组图谱组织(TCGA)门户网站UALCAN泛癌症分析DHX16的表达及其与预后关系;通过蛋白之间相互作用平台InBio MapTM下载与DHX16相互作用的蛋白质谱,经DAVID 6.8进行基因本体(GO)和KEGG信号通路分析。结果 DHX16在膀胱尿路上皮癌、头颈部鳞状细胞癌、食管癌、肝脏肝细胞癌和胆管癌中高表达(均P < 0.001);DHX16高表达利于膀胱尿路上皮癌预后,而不利于肾上腺皮质癌、肉瘤、脑低级别胶质瘤、肝脏肝细胞癌和急性髓样白血病的预后。DHX16相互作用蛋白主要定位于剪接体、细胞核、质膜、胞内核糖核蛋白复合体等,参与mRNA剪接、加工过程等,主要结合多聚腺苷酸RNA、核苷酸、核酸、mRNA内含子等,具有RNA解旋酶活性等功能;参与的信号通路主要包括剪接体、mRNA监测、RNA降解和RNA转运过程。结论 DHX16在膀胱尿路上皮癌、头颈部鳞状细胞癌、食管癌、肝脏肝细胞癌和胆管癌中高表达,DHX16高表达有利于膀胱尿路上皮癌预后,而不利于肾上腺皮质癌、肉瘤、脑低级别胶质瘤、肝脏肝细胞癌和急性髓样白血病预后,因此可作为上述肿瘤预后的潜在标志物。

关键词: 泛癌症分析, DEAH盒解旋酶16, 预后

Abstract: Objective To investigate the expression and prognostic significance of DEAH-box helicase (DHX16) by pan-cancer analysis. Methods The expression and prognostic significance of DHX16 were analyzed using the UALCAN web-portal. Gene ontology and kyoto encyclopedia of genes and genomes analyses of proteins interacting with DHX16 were performed using DAVID 6.8 functional annotation software. Results DHX16 was highly expressed in bladder urothelial carcinoma,head and neck squamous cell carcinoma,esophageal carcinoma,liver hepatocellular carcinoma,and cholangiocarcinoma (all P < 0.001). Proteins interacting with DHX16 were located mainly in catalytic step 2 spliceosome,nucleoplasm,and cell membrane,and participated in mRNA splicing and processing,binding to poly (A) RNA and nucleic acids,and RNA helicase activity. Spliceosome,mRNA surveillance,RNA degradation,and transport pathways were implicated. Conclusion The high expression of DHX16 is helpful for the prognosis of bladder urothelial carcinoma prognosis,and unfavorable for prognoses of adrenocortical carcinoma,sarcoma,brain lower grade glioma,liver hepatocellular carcinoma,and acute myeloid leukemia. Thus,DHX16 may have value as a prognostic marker.

Key words: pan-cancer analysis, DEAH-box helicase, prognosis

中图分类号: 

  • R73
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