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中国医科大学学报 ›› 2016, Vol. 45 ›› Issue (5): 398-401.doi: 10.12007/j.issn.0258-4646.2016.05.004

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利用TCGA数据集分析AKT3在胃癌中的表达及临床意义

王硕,李智,郑春雷,曲秀娟,刘静,曲晶磊,车晓芳,刘云鹏   

  1. 中国医科大学附属第一医院肿瘤内科,沈阳 110001
  • 收稿日期:2016-03-07 出版日期:2016-05-30 发布日期:2016-05-09
  • 通讯作者: 刘云鹏 E-mail:liuyunpeng@medmail. com. Cn
  • 作者简介:王硕(1983 -),女,医师,博士研究生.
  • 基金资助:
    国家自然科学基金(81302023);国家科技重大新药创制(2013ZX09303002);辽宁省科学技术计划(2014225013)

Analysis of Clinical Significance of AKT3 Expression in Gastric Cancer Utilizing TCGA Datasets

WANG Shuo,LI Zhi,ZHENG Chunlei,QU Xiujuan,LIU Jing,QU Jinglei,CHE Xiaofang,LIU Yunpeng   

  1. Department of Oncology,The First Hospital,China Medical University,Shenyang 110001,China
  • Received:2016-03-07 Online:2016-05-30 Published:2016-05-09

摘要: 目的 研究 AKT3 在胃癌中的表达情况,预测并探讨 AKT3 参与肿瘤发生发展的可能机制及临床价值。方法 从癌症基因组图谱(TCGA)数据库收集胃癌数据集,下载 AKT3 基因表达谱资料及临床信息资料。分析 AKT3 表达与胃癌临床病理学参数的相关性及对预后的影响。采用基因集富集分析(GSEA)方法预测 AKT3 的调控基因。结果 AKT3 表达水平与肿瘤浸润深度(P = 0.001)、TNM 分期(P = 0.049)、分化程度(P < 0.001)相关,肿瘤恶性程度越高,AKT3 表达越高。AKT3 高表达患者总生存期明显短于低表达患者(P < 0.001)。AKT3 高表达样本富集了细胞黏附、骨架蛋白调控、紧密连接、TGF-β通路等基因集。结论 在胃癌中,AKT3 高表达是一种预后不良因素,可以作为预测患者转移发生、判断预后的有效生物标志物。

关键词: 胃癌, 癌症基因组图谱, AKT3, 预后

Abstract: Objective To investigate the prognostic value of AKT3 expression in gastric cancer. Methods AKT3 expression data in The Cancer Genome Atlas(TCGA)datasets and its clinical information were downloaded. Statistically assessed was performed for relationship with clinicopathological factors and prognosis. Gene set enrichment analysis(GSEA)was used to predict the gene sets modulated by AKT3. Results The expression of AKT3 was associated with T stage(P = 0.001),TNM stage(P = 0.049)and differentiation(P < 0.001).High level of AKT3 expression indicates poor prognosis(P = 0.001). AKT3 could regulate gene sets involving cell adhesion molecule, cytoskeleton regulation, focal adhesion and TGF- β signaling pathway. Conclusion AKT3 could be used as a potential prognostic marker and a therapeutic target in gastric cancer.

Key words: gastric cancer, cancer genome atlas, AKT3, prognosis

中图分类号: 

  • R735.2
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